Statistiques sur la flore de France métropolitaine

Combien d'espèces compte la flore de France métropolitaine ?
Quelles familles sont les plus représentées ?

Voici à quoi ce post tente de répondre.

Entre 5007 et 8785

C'est, respectivement, le nombre d'espèces mises en clé dans Flora Gallica (publiée en 2014) et listées dans la Base de Données Taxonomiques de France Métropolitaine : BDTFX (version 3.01 de septembre 2015).
NB : ces chiffres n'incluent pas les taxons infraspécifiques : sous-espèces et variétés entre autres, mais prennent en compte les hybrides.

On remarquera que dès 1815, A. de Candolle annonçait un nombre d'espèces proche de 6000 pour la flore de France.

Par ailleurs il est intéressant de noter que la flore de Bonnier (la "grande") comptait 3346 espèces, la flore de Coste (1901) en recensait 4350 espèces, celle de Fournier (1ère édition 1947, 2e édition 1977) en compteraient "seulement" 4220 et celle de Guinochet et de Vilmorin (1975 à 1987, dite "flore du CNRS") : 4565 espèces. [source]

Enfin on peut signaler qu'en octobre 2015 le projet chorodep de Tela Botanica coordonné par Philippe Julve recense 7268 espèces en France.

On peut expliquer ces disparités par la différence de traitement des auteurs : a priori, Fournier aurait considéré comme simples sous-espèces des taxons qui sont aujourd'hui reconnus comme étant bien de rang spécifique. De manière identique la flore du CNRS auraient été trop synthétique. Par ailleurs le traitement des genres complexes peut faire varier le total de manière importante : en effet, selon les auteurs, la France peut compter plusieurs centaines d'Épervières (Hieracium), d'Ophrys (un genre d'orchidées), de Ronces (Rubus), de Rosiers (Rosa), ou encore d'Alchémilles (Alchemilla).

Enfin il faut signaler que les nombres indiqués incluent toujours les hybrides de rang spécifique. Si ceux-ci sont difficile à évaluer dans les flores du XX^e siècle, on connaît précisément leur nombre dans Flora Gallica : 107, et dans la BDTFX : 1338.

Des Asteracées aux Zygophyllacées
Les Asteracées (anciennement Composées) constituent la famille la plus représentée de la flore française, et ce même si on en retranchait les très nombreuses Épervières (378 Hieracia) et Pissenlits (138 Taraxaca).

Au total, 8 familles totalisent à elles seules la moitié de la flore française en nombre d'espèces : Astéracées, Rosacées, Orchidacées, Poacées, Fabacées, Brassicacées, Apiacées et Caryophyllacées. Alors que l'on compte actuellement en France métropolitaine 197 familles représentées par au moins une espèce.

Au sein des Rosacées, deuxième famille la plus représentée, le seul genre Rubus (les ronces) compte pour 192 espèces, suivi des Alchémilles (99 espèces), des Rosiers (69 espèces) et - fait surprenant - des Cotoneaster avec 54 espèces, plus que les Potentilles : 51 espèces.
Enfin on notera qu'au sein des Orchidacées (3^e famille), le genre Ophrys contribue à lui seul à hauteur 203 espèces, soit plus que les Ronces ou que les Pissenlits !

Famille	Nbre d'espèces	Genre	Nbre d'espèces
Asteraceae	1258	Hieracium	378
Rosaceae	648	Ophrys	203
Orchidaceae	581	Rubus	192
Poaceae	570	Taraxacum	138
Fabaceae	472	Carex	127
Brassicaceae	289	Ranunculus	119
Apiaceae	274	Alchemilla	99
Caryophyllaceae	269	Dactylorhiza	84
Lamiaceae	241	Rosa	69
Ranunculaceae	230	Festuca	64
Cyperaceae	198	Pinus	62
Plantaginaceae	171	Euphorbia	61
Pinaceae	151	Trifolium	61
Orobanchaceae	118	Dianthus	58
Boraginaceae	113	Galium	58
Amaryllidaceae	102	Allium	57
Caprifoliaceae	99	Saxifraga	56
Rubiaceae	86	Veronica	55
Asparagaceae	85	Cotoneaster	54
Crassulaceae	85	Potentilla	51
Iridaceae	84	Pilosella	50
Campanulaceae	83	Verbascum	50
Scrophulariaceae	82	Limonium	48
Amaranthaceae	81	Salix	47
Polygonaceae	77	Sedum	45
Primulaceae	77	Anacamptis	44
Cistaceae	75	Cistus	44
Ericaceae	75	Silene	44
Euphorbiaceae	72	Vicia	43
Plumbaginaceae	72	Quercus	42
Saxifragaceae	70	Abies	41
Papaveraceae	67	Campanula	41
Onagraceae	62	Juncus	40
Salicaceae	61	Viola	40
Juncaceae	60	Asplenium	38
Geraniaceae	58	Centaurea	35
Cupressaceae	56	Lathyrus	35
Liliaceae	55	Eryngium	34
Solanaceae	55	Oenothera	34
Gentianaceae	54	Orchis	34
Autres familles	1369	Autres genres	5910
Total	8785	Total	8785

Enfin 22 familles ne sont représentées que par 2 espèces seulement, et 37 familles ne sont représentées que par 1 seule espèce, entre autres : Aquifoliacée - le houx, Ginkgoacée - le Ginkgo biloba, Myricacée - le Piment royal, Osmondacée - l'Osmonde royale, Posidoniacée : la Posidonie – « algue » méditerranéenne, Simaroubacée : l'Ailanthe, et enfin Zygophyllacée : la Fabagelle, espèce rare en France présente surtout sur le littoral de l'Hérault (vers Sète).


Comment se procurer les données brutes pour vérifier ces informations et suivre l'évolution à l'avenir :

Vous pouvez télécharger la BDTFX (NB : il s'agit de la source de donnée utilisée par le Muséum National d'Histoire Naturelle pour TAXREF), en vous rendant sur Tela Botanica :
Botanique > Téléchargements > Référentiels
Pour les besoins de ce post, j'ai choisi le téléchargement personnalisé, et dans "Sélectionner les données", j'ai coché les deux options : "que les noms retenus" et "que les taxons présents en France", et j'ai laissé toutes les autres options par défaut.

Il suffit ensuite d'ouvrir le fichier téléchargé dans une feuille de calcul (comme Libre Office Calc) et d'effectuer quelques opérations simples :

1. Appliquer un filtre automatique et trier les données pour n'afficher que celles correspondant au code rang 290 : le code pour le rang d'espèce.

2. Sélectionner l'ensemble des lignes restantes et les copier/coller dans une autre feuille (sans oublier la ligne d'en-tête).

3. On peut alors sélectionner la colonne "Famille (APG III)" et aller dans le menu : "Données" > "Table de Pilote" (= ex "Pilote de données") > "Créer"
Dans la fenêtre qui s'affiche on conserve l'option cochée "Sélection actuelle" et on clique sur "OK".
On fait un glisser-déposer du bouton "Famille (APG III)" dans les cadres "Champ lignes" et "Champ données", puis dans "Options" on choisit "Contingent" et on valide en cliquant sur "OK" et à nouveau sur "OK".

Voilà la procédure de base d'obtention des données.

Autres sources :
Commentaires de Philippe JULVE, Jean Claude BOUZAT, Errol Vela, Jean-Marc Tison, Daniel Chicouène et David Mercier sur la liste ISFF de Tela Botanica, retranscrits sur l'outil Q&R de Tela Botanica.